立藤美学园，仅仅因为一个入侵者——“它们”，而化作了地狱的坩埚！“它们”袭击人，咬人，产生出新的“它们”席卷了整个学园。在化成恶魔的世界的学园内，小室孝和青梅竹马宫本丽、朋友井豪永，暂时去避难。但是，为了保护丽而被“它们”咬的永却变成了“它们”……剩下来的两人，与其他幸存者，同级同学高城沙耶、平野户

　　这是五十年后的未来，世界被“神”吞噬殆尽而荒芜的架空故事。 由于遭到突如其来的怪物“荒神”的破坏而失去平衡。在人类文明既有的兵器都因荒神的“捕食”本能而无效化下，生化科技企业“芬里尔”成功利用荒神细胞开发出了名为“神机”的生物兵器。并同时组织了特殊部队“GOD EATER”。自此，人类终于获得了

　　这个学校到底在搞什么东东？！这个兽耳少女到底是什么鬼啊？　　谜样兽耳少女的真面目揭晓！？ 笑闹暴走的三人新生活一团乱登场！　　羽濑川拓人，一个平凡无奇且极度中庸的高中生，不管做什么事都不突出，表现也是一路平～～到底，在学校甚至有“2年B班平均分数计算机”之称。然而如此平凡的他，却是在隐藏于现代社

　　地球上的人类的安危被来自冥王星的巨大陨石Tanatos(希腊神话)所威胁着。为了对抗Tanatos，人类以国际太阳系开发机构“ISDA”为发足点，秘密进行着一向不为人知的开发计划“D计划”，计划内容为利用在小笠原近海发现的迷之生命体“龙”进行生态兵器的开发，然后利用“龙”去直接破坏Tanatos

　　这一天，个性温柔的美少女万城目富美（高部爱 配音）即将开始崭新的高中的生活，此时，一个熟悉的身影出现在了她的视线中。名叫奥平明（仪部ゆう子 配音）的女孩，竟是富美分别了近十年的青梅竹马。这意外的相遇为久违的两人带来了小小的惊喜和快乐，而富美对小明的感情，也在相处的时日中渐渐明朗。爱哭的富美和活泼

　　建造于郊外的工厂旧址的巨大集合住宅。最近，女高中生的诡异尸体被发现，难以理解的灵异现象遭到目击等等，种种传闻不绝于耳的地方。搬家到此处的18岁女大学生凛，因一个偶然的契机而遭遇了怪异。对死亡的诅咒感到恐惧的她，在与探查这所建筑物之谜的民俗学者时世，以及咒术师斋恩等人相遇的同时，自己也逐渐逼近怪异

　　城市里连续发生着不可思议的奇怪事件，还有为解决事件聚集起来的拥有特殊力量的少女：修道院里的十四岁孤儿----叶山小十乃、身为偶像的----白藤菜月以及与前世的噩梦战斗的谜之少女----圣三咲。　　想要审判污秽现有世界的人，想要保护现有世界的人，谁代表正义？谁又代表邪恶？　　失去记忆的少年出现了，